События сериала «Больница Никербокер» разворачиваются в начале двадцатого века в Нью-Йорке. Специалисты госпиталя «Никербокер» всеми сила борются за жизнь своих подопечных.

Главный герой сериала – это высокомерный и своенравный, но талантливый хирург Джон Тэккери. Мужчина просто гений своего времени, он пытается вывести медицину двадцатого века на новый уровень, но героя мало кто поддерживает, так как в своих операциях он использует достаточно сомнительные для того времени методы. При всём прочем Тэккери наркоман, который тщательно пытается скрыть свою зависимость от коллег и близких, но ему это не очень-то хорошо удаётся.

По началу в разработке новых методик Джону Тэккери помогает его коллега - доктор Джулс Кристианс, однако потеряв очередную пациентку врач не выдерживает и совершает самоубийство.

После смерти Джулса ситуация в госпитале усложняется, больницу отказываются финансировать, а Джон тем временем получает повышение и становится главврачом хирургического отделения.

В больнице «Никербокер» появляется новый сотрудник – темнокожий первоклассный специалист Элджернон Эдвардс. Элджернону в своё время повезло и состоятельные люди оплатили его обучение в Гарварде. Но в виду расовых предрассудков того времени героя не подпускают к ответственной работе. Однако Теккери знает, чем занять нового сотрудника.